Pomidory gniją na winorośli z kilku powodów, w tym niespójnej wilgoci, nadmiernego nasłonecznienia, ataków szkodników i narażenia na choroby. Pierwsze trzy problemy można rozwiązać, gdy roślina rośnie, aby zmniejszyć zgniliznę owoce, ale uprawy narażone na choroby powinny zostać zniszczone.
Inwazja szkodników jest jednym z najłatwiejszych do zdiagnozowania problemów, ponieważ błędy są często obecne, a ich efekty są różne. Brzydkie pluskwy tworzą ciemne plamy na pomidorach, gdy się je karmią, pozostawiając obszar, który zmienia kolor na żółty lub pozostaje zielony, gdy owoce dojrzewają. Hornhorny często znajdują się pod liśćmi, a ich ślady podawania są widoczne na liściach i owocach.
Gdy pomidory otrzymują zbyt dużo słońca, występuje stan zwany sunscald, a owoce rozwijają białe plamy o skórzanej teksturze. Gnicia końca drzewa pojawia się, gdy pomidory otrzymują niespójną wilgoć, hamując zdolność rośliny do przyjmowania wapnia. Gnijąca powoduje jasnobrązowe plamy na końcu pomidora, a te plamy ostatecznie stają się czarne.
Pomidory są podatne na zarazę, wirus mozaiki tytoniu i więdnięcie. Objawy tych chorób obejmują szare, spleśniałe obszary na owocach, a także zniekształcone liście i raki na owocach lub łodydze. Choroby, które dotykają pomidorów, mogą pozostać w glebie, a usługa rozbudowy stanu Colorado State zaleca sadzenie innych upraw na dotkniętych obszarach przez co najmniej dwa lata po wykryciu choroby.
