Chociaż FDA nie oczyściła żadnego płynnego środka dezynfekującego, który wykorzystuje alkohol jako główny środek do stosowania w warunkach klinicznych, alkohol izopropylowy okazał się skuteczny w zabijaniu mikroorganizmów w pewnych warunkach, zgodnie z Centrum Kontroli i Zapobiegania Chorobom. Wśród różnych rodzajów alkoholu dostępnych do sterylizacji alkohol izopropylowy jest konsekwentnie jednym z najbardziej bakteriobójczych.
Jak donosi CDC, badania kliniczne przeprowadzono na alkoholu metylowym, alkoholu etylowym i alkoholu izopropylowym w celu określenia ich względnej skuteczności w sterylizacji powierzchni. Wszystkie formy alkoholu uległy znacznemu spadkowi skuteczności po rozcieńczeniu do stężenia poniżej 50 procent. Żaden nie okazał się zdolny do zabijania zarodników bakterii lub przenikania grubych warstw białkowych. Spośród testowanych odmian alkohol izopropylowy wykazał jednak zdolność zabijania wirusów zarówno w przypadku wirusowego zapalenia wątroby typu B, jak i opryszczki. Był on nieco bardziej skuteczny niż alkohol etylowy przy dezynfekcji populacji E. coli i S. aureus.
Stwierdzono również, że alkohol izopropylowy był skuteczny w dezynfekcji głowic głowic wielokrotnego użytku. CDC ostrzega jednak, że środki bakteriobójcze na bazie alkoholu na ogół nie są zalecane do sterylizacji narzędzi chirurgicznych. Wynika to z faktu, że żaden z testowanych środków nie był w stanie niezawodnie usunąć zarodników różnych pałeczek, a śmiertelne infekcje były czasami wykrywane przy użyciu narzędzi traktowanych alkoholem.
