Woda w studni może się zabrudzić, gdy w systemie wiertniczym brakuje konserwacji, co może prowadzić do jej pogorszenia. Może trzeba będzie wyczyścić studnie, a ponieważ niektórzy ludzie nigdy tego nie robią, woda może się zabrudzić.
Może to nastąpić w ciągu zaledwie kilku lat, jeśli odwiert nie zostanie odpowiednio oczyszczony. Zbyt dużo żelaza, manganu i siarkowodoru może spowodować zanieczyszczenie wody studziennej. Osoby, które mają ten problem, mogą zauważyć nieprzyjemny zapach pochodzący z ich systemu wodnego. Może to stanowić poważny problem, wypełniając dom zapachem przypominającym kanał lub siarki.
Studnie mogą zostać zanieczyszczone bakteriami, takimi jak bakterie typu coli i inne typy bakterii. Heterotroficzna liczba płytek może być wykorzystana do ustalenia, ile bakterii znajduje się w wodzie. Chociaż ten test nie może być bardzo specyficzny, daje dobre podsumowanie stanu studni.
Kiedy bakterie stają się problemem, studnie muszą być oczyszczone i odkażone. Jeśli tak się nie stanie, studnia staje się pożywką dla bakterii. Bakterie mogą dostać się do umytych ubrań, a także talerze, urządzenia i ciała ludzi, gdy próbują brać prysznic. To nie jest po prostu brudne, niezdrowe, ponieważ te bakterie mogą wywoływać choroby.