Firma Uniqlo została założona w Hiroszimie w Japonii w 1984 roku. Początkowo była zwykłym sklepem odzieżowym, a jej nazwa oznacza "Unique Clothing Warehouse". Firma Uniqlo została założona w ramach firmy Fast Retailing i została wydzielona do spółki zależnej będącej w 100% własnością Fast Retailing przed jej ekspansją międzynarodową.
Firma macierzysta Uniqlo, Fast Retailing, została nazwana Ogori Shoji do 1991 roku. Ogori Shoji została założona w 1949 roku w Yamaguchi w Japonii. Przed założeniem Uniqlo Ogori Shoji sprzedawał odzież męską za pośrednictwem sieci sklepów Men's Shop OS. Uniqlo było pierwszym sklepem odzieżowym unisex firmy.
Sklep został założony, aby zapewnić odzież dostosowaną do wszystkich stylów. Projekty Uniqlo miały być proste, aby klienci mogli je dostosować do istniejących szaf i stylów. Produkty Uniqlo miały być niezależne od trendów mody i różnic stylu między grupami wiekowymi, płciami i regionami.
Uniqlo po raz pierwszy rozwinął się poza Japonią w 2002 roku. Oryginalne międzynarodowe sklepy znajdowały się w Chinach i Wielkiej Brytanii. Firma rozszerzyła działalność na Stany Zjednoczone, Hongkong i Koreę Południową w 2005 r., A także na Malezję w 2010 r. Lokalizacje Uniqlo zostały również otwarte w Australii, Bangladeszu, Francji, Makau i Indonezji, a także na Filipinach, w Rosji, Singapurze, na Tajwanie i Tajlandia.