Windex zawiera szkodliwe chemikalia, takie jak wodorotlenek amonu, heksoksyetanol i zapach substancji chemicznych, zgodnie z Environmental Working Group. Preparat do czyszczenia szkła zawiera także glikol propylenowy, substancję budzącą kontrowersje, używaną w pastach do zębów i kosmetykach. Daily Finance twierdzi, że SC Johnson stworzył stronę internetową w marcu 2009 roku, która wyjaśnia wiele składników w produktach czyszczących firmy.
Wodorotlenek amonu jest znanym środkiem drażniącym dla układu oddechowego, który może uszkodzić wzrok i skórę. Grupa robocza EWG stwierdza również, że wodorotlenek amonu powoduje ostrą toksyczność w środowisku wodnym. Heksoksyetanol może wpływać na narządy, a zapach może prowadzić do alergii, podrażnień skóry i problemów z układem nerwowym. EWG wymienia Windex jako umiarkowaną troskę o astmatyków i tych, którzy cierpią na dolegliwości układu oddechowego. Drażnienie skóry to kolejny problem, który naukowcy mają do czyszczenia szkła.
Daily Finance zwraca uwagę, że Windex używa glikolu propylenowego, substancji uważanej za bezpieczną przez amerykańską agencję ochrony środowiska. Ekolodzy twierdzą, że badania pokazują, że glikol propylenowy powoduje uszkodzenie nerek i wątroby.
Forbes informuje o kompleksowym badaniu domowych produktów czyszczących, w tym Windex, doszedł do wniosku, że wiele produktów ma szerokie spektrum efektów zdrowotnych. Jednym z najbardziej zauważalnych efektów zdrowotnych była astma, a inna zaburzenie endokrynologiczne.
Oficjalna strona What's Inside SC Johnson wymienia kilka składników swojego środka do czyszczenia szyb Windex. Woda, alkohol izopropylowy, 2-heksoksyetanol, Videt EGM, sulfonian sodowy c14-17 sec, wodorotlenek amonu, glikol propylenowy, Mirapol Surf S-10, zapach i Liquitint Sky Blue Dye są w butelce z Windexem.