Niektóre zalety hydroponiki obejmują minimalne zużycie wody i nawozów, mniejsze wymagania konserwacyjne, wysoki plon, wydajność przestrzenną i zdolność do uprawy roślin w trudnych warunkach i przez cały rok. Wadą hydroponiki jest wysoki koszt instalacji i obsługi systemu.
System hydroponiczny zmniejsza zużycie wody, ponieważ woda jest dostarczana bezpośrednio do korzeni roślin. System pozwala również na recykling wody do nawadniania. Ponieważ korzenie roślin dostarczają wodę, minimalizuje to stratę nawozu przed spływem, zmniejszając w ten sposób ilość potrzebnego nawozu.
Kolejną zaletą jest fakt, że system nie wymaga regularnego usuwania chwastów. Ponieważ oświetlenie, poziom składników odżywczych i pH są kontrolowane w systemie hydroponicznym, hodowca ma lepszą kontrolę nad procesem wzrostu i może łatwiej chronić rośliny przed zanieczyszczeniami i szkodnikami. W rezultacie plony z systemu hydroponicznego są wysokie. Ponadto rośliny mają tendencję do szybszego wzrostu w sprzyjających warunkach, co zwiększa liczbę cykli wzrostu w określonym przedziale czasowym.
Ponieważ system hydroponiczny nie zależy od zewnętrznych warunków środowiskowych, takich jak jakość gleby, dostępność światła słonecznego i zmieniające się pory roku, rośliny mogą być uprawiane nawet na pustyniach, w regionach o niskiej jakości gleby i przez cały rok. Również rośliny uprawiane za pomocą hydroponiki mają mniejsze korzenie, co pozwala im być bliżej siebie.
Koszt instalacji systemu hydroponicznego jest jednak wyższy niż koszt potrzebny do założenia ogrodu glebowego. Ponieważ system wymaga więcej pracy, jego koszty operacyjne również są wysokie. Konfiguracje na dużą skalę są bardziej opłacalne niż mniejsze.
