Paliwa używane w doniczkach do fondue obejmują butan, alkohol etylowy, alkohol izopropylowy, świece i paliwo żelowe. Użytkownicy powinni zapoznać się z instrukcjami producenta dołączonymi do garnka do fondue w celu określenia najlepszych paliw dla tego fondue. model.
Paliwa płynne, takie jak alkohol i butan, powodują gorętszy płomień niż żele i świece. Opcje dotyczące paliwa płynnego powinny być stosowane w przypadku przepisów na fondue, które zawierają mięso i produkty mleczne, aby zapewnić bezpieczeństwo żywności.
Świece i lampki do herbaty są czasem używane w fondue o niskiej temperaturze do czekoladowych fondue i innych deserów. Świeca utrzymuje płyn w cieple i leje się.
W przypadku niektórych doniczek do fondue, takich jak te wytwarzane przez Le Creuset, paczki żelowe są używane do podgrzewania puli. Te pakiety żelu trwają przez jedną lub dwie receptury, po czym trzeba je wymienić.