Pot może być przyczyną śmierdzących stóp, ale sam pot nie jest zwykle przyczyną zapachu. Interakcje bakterii Staphylococcus epidermidis, Bacillus subtilis i Brevibacterium linens na stopie są głównymi przyczynami śmierdzących stóp. Stopa może pachnieć z interakcji jednej z bakterii lub wszystkich trzech.
Zapach jest wynikiem naturalnych bakterii obecnych na stopie, które uwalniają pot pochodzący z jednej z najtrudniejszych części ciała. Staphylococcus epidermidis i Bacillus subtilis przebywają na nogach, aby jeść leucynę, która jest aminokwasem znajdującym się w potu stóp. Gdy bakteria trawi aminokwas, kwas izowalerianowy powstaje w wyniku interakcji, która wydziela gazowy zapach. Zapach Staphylococcus epidermidis i Bacillus subtilis jest opisany jako ocet.
W przeciwieństwie do apetytu Staphylococcus epidermidis i Bacillus subtilis na pot, pościel Brevibacterium zjada suchą i łuszczącą się martwą skórę na stopie. Bakteria ta żyje w gorącym i wilgotnym środowisku, ale zjada martwą skórę na stopie, niezależnie od tego, czy stopa jest spocona czy nie. Cuchnąca siarka gazowa powstaje z bakterii zamieniających martwe komórki w metanetiol, który ma zgniły zapach jajka lub kapusty.