Drzewa Bonsai mogą stracić liście z kilku różnych powodów. Do przyczyn tych należą: zszokowanie, brak wystarczającej ilości światła, utrzymywanie w niskiej temperaturze lub nadmierne podlewanie lub podlewanie.
Drzewa Bonsai, które tracą liście przed zszokowaniem, mogły pozostawać w ciemnym polu przez zbyt długi czas mogą sygnalizować, że środowisko zmieniło się drastycznie. Zwrócenie drzewa do odpowiednio oświetlonego środowiska powinno przywrócić drzewo do zdrowia.
Drzewa Bonsai nie powinny być pozostawione w bezpośrednim świetle słonecznym, ale zbyt mało światła może powodować bladość liści i wzrost ich w długich, wrzecionowatych pędach. Zapewnienie odpowiedniej ilości światła zapewnia zdrowe liście. Można używać sztucznego oświetlenia fluorescencyjnego, które powinno być zapewnione przez 10 godzin dziennie.
Ekstremalne zimno lub nadmierne podlewanie może spowodować, że liście nabiorą koloru czarnego lub brązowego na końcach. Tropikalne gatunki drzewek bonsai powinny być przechowywane w temperaturze pokojowej w domu. Subtropikalne gatunki mogą wytrzymać niższe temperatury.
Właściwe nawadnianie jest ważne dla zachowania zdrowych liści. Woda tylko w razie potrzeby, nie w regularnych odstępach czasu lub w ciągu określonej liczby dni, aby zapewnić najlepsze nawodnienie drzewa i liści.
Drzewa Bonsai obejmują gatunki szerokolistne i iglaste. Gatunki szerokolistne mogą być zimozielone lub liściaste z przeciwnymi liśćmi (dwa liście wyrastają z tego samego punktu) lub naprzemianymi liśćmi. Drzewa iglaste są głównie zimozielone, ale istnieje kilka gatunków liściastych. Liście na drzewach iglastych obejmują zarówno igłopodobne jak i podobne do skali odmiany.