Koszt pluszowych zwierząt Webkinz zależy od miejsca zakupu zabawek i wybranej zabawki. Na przykład cena Amazonka za Webkinz Sparkle Harp Seal w 2014 roku wynosiła nieco ponad 13 USD. W internetowym sklepie Jungle Store wymieniono tę samą zabawkę za 9,99 USD.
Niektóre Webkinz są znacznie tańsze. Na przykład, Webkinz Pink Googles, pluszowa kaczka, może kosztować około 3 USD na Amazon. Sklep Jungle oferował różowe Googles za 3,99 USD. Droższe zwierzęta, takie jak Webkinz Signature Moose Plush, mogą osiągnąć cenę 22 USD na Amazon i prawie 18 USD w sklepie Jungle.