Istnieje wiele serwerów "Minecraft" przeznaczonych dla pakietu Pixelmon, z których każdy ma swoje zalety. Aby zagrać, najpierw zainstaluj pakiet modów Pixelmon za pomocą programu ładującego moduły Technic Launcher lub Forge, a następnie wybierz serwer do przyłączenia.
Pakiet modów Pixelmon zmienia grę "Minecraft", aby stworzyć hybrydę z grą "Pokémon". Początkujący użytkownicy są proszeni o wybranie początkowego Pokémona, a następnie otrzymują wolną rękę do walki i przechwytywania innych Pokemonów. Poké Balls są wykonane przy użyciu Apricorns, wlewków żelaza i kamiennych guzików. Aby walczyć z dzikim Pokémonem lub innym trenerem, rzuć kulą Poké i uderz swojego przeciwnika. Spowoduje to otwarcie menu bitwy.
Po dołączeniu do serwera Pixelmon pojawiają się nowe opcje gry. Handel staje się dostępny, podobnie jak wydarzenia, konkursy i kompilacje grupowe. Niektóre serwery dostosowują grę, usuwając obrażenia od upadków, głód i naturalne moby "Minecraft". Inne serwery koncentrują się bardziej na środowisku i tworzą rozbudowane struktury dla PokééCenter i siłowni. Od 12 lipca 2015 r. Trzy najlepsze serwery Pixelmon na Pixelmonservers.com to DestinyMC, RC-Pixelmon i PPMC Pixelmon Network.
Wiele wysokonakładowych serwerów Pixelmon oferuje płatne usługi, takie jak zwiększenie pozycji gracza lub rzadkie przedmioty w grze. Te oferty i opłaty są różne.