Różnica między Jowiszem a Zeusem polega na ich pochodzeniu. Zeus pochodzi z greckiej mitologii, a Jowisz z mitologii rzymskiej. Mają jednak wiele podobieństw. Prawdopodobnie inspiracją dla Jowisza był Zeus.
Zeus i Jowisz są sobie wzajemnie ekwiwalentami, ale pochodzą z różnych starożytnych cywilizacji. Zeus, z greckiej mitologii, jest królem bogów i władcą nieba. Często jest przedstawiany jako rzucający błyskawice i rządzące burze. Jowisz, od starożytnej rzymskiej mitologii, jest przedstawiony i opisany w ten sam sposób. Oboje są małżeństwem swoich sióstr i obaj są królem bogów stworzonych w ich własnej gałęzi mitologii.
Zeus jest ogólnie bardziej popularny i ma wiele związków z bogiem, w które wierzy większość współczesnych chrześcijan, choć wciąż jest porównywalny z Jowiszem. Na przykład w historii narodzin Jezusa Chrystusa Dziewica Maryja została zaimpregnowana przez Ducha Świętego. W wielu greckich opowiadaniach Zeus impregnuje dziewicę, a dziecko dorasta, by robić wielkie rzeczy i ostatecznie staje się bohaterem. Zarówno Jowisz, jak i Zeus są przedstawieni jako osoby mające bardzo osobiste relacje z rasą ludzką, a obie są połączone z legendarnymi powodziami, które zniszczyły ludzkość.