USB 2.0 i USB 3.0 różnią się szybkością transferu, możliwościami zarządzania energią i strukturą. USB 3.0 oferuje zwiększone prędkości przesyłu, maksymalną moc magistrali i lepsze zarządzanie energią.
Największa różnica między USB 2.0 i 3.0 to szybkość, z jaką każdy może komunikować się z kontrolerem hosta komputera. USB 2.0 oferuje szybkość transferu 480 Mb /s. USB 3.0 oferuje szybkość transferu 4,8 Gb /s, która jest 10 razy szybsza niż 2,0, co rewolucjonizuje transfer danych między urządzeniami a komputerem. W niektórych przypadkach prędkość transferu zależy od używanego urządzenia, a także od typu magistrali, portu i kabla.
Pod względem struktury złącze USB 2.0 ma cztery przewody, a USB 3.0 ma dodatkową magistralę fizyczną, która podwaja przewody do ośmiu. Chociaż złącze USB 3.0 jest kompatybilne wstecznie z portem USB 2.0, połączenie działa tylko z szybkością 2.0.
Pod względem zużycia energii i wymagań, USB 2.0 zapewnia do 500mA, a USB 3.0 zapewnia do 900mA i ułatwia zasilanie z sieci energochłonnych urządzeń. 3.0 Urządzenia USB zapewniają więcej mocy gadżetom i oszczędzają energię, gdy urządzenie jest bezczynne i podczas ładowania. Urządzenia są całkowicie odłączane od zasilania, gdy nie są używane.