Podstawową zaletą dołączenia GUI do oprogramowania jest ułatwienie większości użytkowników korzystania z aplikacji. Główną wadą jest to, że wykorzystuje więcej zasobów systemowych, a tym samym obniża ogólną wydajność oprogramowania. Ponadto interfejsy graficzne często zapewniają użytkownikowi mniej szczegółową kontrolę nad operacjami.
GUI zapewnia początkującym użytkownikom wizualne wskazówki, które pomagają w prowadzeniu i zapewniają natychmiastową reakcję na każde podejmowane działanie. O wiele łatwiej jest typowej osobie odkrywać i wykorzystywać funkcje identyfikowane za pomocą obrazu, takie jak znak zapytania oznaczający pomoc lub ikonę drukarki w celu oznaczenia funkcji drukowania. Jednak z powodu tych grafik, oprogramowanie używające GUI często działa znacznie wolniej niż aplikacje bez tej warstwy. Dodatkowo, w zależności od metody użytej do utworzenia GUI, oprogramowanie może nie działać na starszych komputerach, które nie mają wymaganej mocy obliczeniowej lub zgodnych elementów graficznych.
Oprogramowanie, które wymaga od użytkownika obsługi go przy użyciu interfejsu wiersza poleceń, ma na ogół znacznie bardziej skomplikowaną krzywą uczenia się. Jednak gdy użytkownik zapozna się z komendami, zwykle działa znacznie szybciej. Doświadczony operator zazwyczaj stwierdza, że opcje dostępne za pomocą wiersza poleceń zapewniają większą moc i elastyczność w korzystaniu z oprogramowania.