Najbardziej znanym zbiornikiem wody w Bolivie jest Jezioro ("Lago" w języku hiszpańskim) Titicaca, największe jezioro w Ameryce Południowej i najwyżej położone komercyjnie jezioro na Ziemi. Inne jeziora w basenie Altiplano obejmują Poopó, Salar de Coipasa, Salar de Uyuni i Uru Uru. Jeziora w dorzeczu Altiplano sięgają od słonawych do słonych. Słodkowodne jeziora na nizinach to Huaytunas, Rogaguado, Rogagua, Guachuna i El Océano.
Najbardziej znaną rzeką w Boliwii jest Amazonka. Inne duże rzeki w dorzeczu Amazonki to Madiera, Beni, Madre de Dios, Mamoré, Yata, Iténez (znany również jako Guaporé), Itonmas (znany również jako San Miguel, San Julián lub San Pablo), Río Blanco (znany również jako Baures lub Agua Caliente), San Martin, Río Grande (znany również jako Guapay) i Acre. W dorzeczu La Plata znajdują się rzeki Paragwaj, Bermejo i Pilcomayo.
Sol de Mañana jest gejzerem w departamencie Potosi w południowo-zachodniej Boliwii. Cieśnina Tiquina jest kanałem, który łączy dwie połowy jeziora Titicaca, większe jezioro Chicuito i mniejsze jezioro Pequeno.
Boliwia jest pozbawiona dostępu do morza i nie łączy się z morzem w żadnym kierunku, chociaż jezioro Titicaca jest wystarczająco duże, by wpłynąć łagodząco na otaczający go klimat.
