Kraje, które nie mają prostokątnej flagi to Nepal, Szwajcaria i Watykan. Te flagi są kwadratowe, z wyjątkiem Nepalu. Jest to podwójne pióro lub flaga w kształcie dwóch trójkątów.
Flaga Nepalu jest jasnoczerwona, co odpowiada kolorowi rododendronu, kwiatu narodowego. Kolor reprezentuje również hart ducha Nepalu. Górny pennon pokazuje półksiężyc, a dolny - słońce. Granica flagi jest niebieska, co symbolizuje spokój. Niektórzy uważają także, że dwa proporczyki symbolizują dwóch wielkich zakonników tego kraju, którymi są hinduizm i buddyzm. Mogą również reprezentować szczyty Himalajów, gdzie znajduje się Nepal.
Flaga Szwajcarii jest kwadratowa i ma biały krzyż na czerwonym tle. Symbolizuje honor, wolność i wierność. Jest flagą narodową od 1889 roku i wzorowany jest na flagie Schwyz, jednego z najstarszych kantonów w kraju.
Watykan jest jednym z najmniejszych krajów na świecie i rządzi nim papież. Jego kwadratowa flaga została przyjęta w 1929 roku i ma jasną żółtą połowę i białą połowę. Żółta połowa jest pusta, ale biała połowa zawiera złote i srebrne klucze św. Piotra i papieską tiarę.
