Bawełna Bt jest genetycznie zmodyfikowaną wersją rośliny, która zawiera geny dla insektycydu. Rośliny bawełny obejmują Bacillus thuringiensis (Bt), bakterię tworzącą zarodniki, która produkuje białka płaczące. Kiedy owady jedzą te bawełniane rośliny, białka płaczu wiążą się z komórkami wewnątrz owadów, zakłócając przepływ potasu przez owady, ostatecznie zabijając go. Bawełna Bt jest produkowana przez Monsanto i uprawiana w Indiach.
Rodzina bakterii Bt zawiera 200 białek, które są szkodliwe dla wielu owadów, zwłaszcza chrząszczy, larw motyli, robaków bawełnianych, much i larw ćmy. W obszarach, w których te szkodniki są kluczowym zagrożeniem dla bawełny, stosowanie bawełny Bt zmniejsza potrzebę stosowania insektycydów o szerokim spektrum działania w uprawach. Jednak Bt jest nieskuteczny w stosunku do innych szkodników, w tym mszyc i ułomków. W niektórych rejonach Chin, użycie insektycydów zostało podniesione do poziomu sprzed Bt na polach bawełny ze względu na konieczność zwalczania tych odpornych na Bt szkodników.
W Stanach Zjednoczonych zużycie bawełny Bt w latach 1996-1998 wynosiło około 5 procent więcej na akr niż w przypadku zwykłej bawełny.
Bawełna Bt jest szeroko stosowana w Indiach, drugim co do wielkości kraju produkującym na świecie. Ponieważ jednak bawełniane nasiona Bt Monsanto są drogie i nie trwają długo po pokoleniu, indyjscy rolnicy rozwinęli własną odmianę, która zawiera nasiona wielokrotnego użytku. Chociaż stosowanie bawełny Bt jest kontrowersyjne w Indiach, 83% bawełny w tym kraju pochodzi z 2012 roku.
