Spider-Man często mówi się, że nie ma żadnej słabości, a przynajmniej żadnej, która jest integralna z fabułą na drodze słabości Supermana do Kryptonite. Według jego profilu postaci Marvela, Spider- Prekognitywne wyczucie pająka i nadludzkie zdolności fizyczne człowieka sprawiają, że jest on praktycznie odporny na zranienie.
Jednak charakter postaci Spider-Mana również stwierdza, że może sabotować siebie poprzez poznawcze odejście od tych autonomicznych odruchów. Innymi słowy, brak wiary we własne instynkty stanowiłoby poważną słabość.
Jego zależność od jego instynktów może być również uważana za słabość. Na przykład, gdy przeziębienie osłabiło jego pajęczyna w "The Amazing Spider-Man # 39" (1966), Zielony Goblin zyskał wyraźną przewagę nad nim.
Podobnie jak wielu superbohaterów, Spider-Man jest również podatny na elektryczność, a także więzy rodzinne lub osobiste, takie jak zły stan zdrowia ciotki May.
