Niewielki wyciek freonu może nie stanowić zagrożenia dla zdrowia, ale narażenie na duże ilości może powodować szkodliwe skutki uboczne, takie jak bóle głowy, zawroty głowy, kołatanie serca i podrażnienie płuc, skóry lub oczu. Dotykanie płynu Freon z gołą skórą może powodować odmrożenia.
Freon wyciekający z urządzenia szybko zamienia się w gaz w temperaturze pokojowej, ograniczając ekspozycję i zagrożenie dla zdrowia. Jako markę dla chemicznych czynników chłodniczych i środków zwiększających ciśnienie powszechnie stosowanych w klimatyzatorach, lodówkach i puszkach natryskowych w przeszłości rząd reguluje produkcję i wykorzystanie Freonu ze względu na jego szkodliwy wpływ na warstwę ozonową. Freon jest bardziej niebezpieczny, gdy zanieczyszcza wodę gruntową lub gromadzi się w jednym miejscu. Freon jest czasami bezpośrednio wdychany w celu rekreacyjnego zażywania narkotyków.
