Użytkownicy mogą wyczyścić lub wymienić filtr w klimatyzatorze okiennym. Niektóre urządzenia mają filtry wielokrotnego użytku, które użytkownicy myją i wkładają z powrotem do klimatyzatora. Inne filtry nie mogą być ponownie użyte i muszą zostać wymienione.
Czyszczenie lub wymiana starego, brudnego filtra może zmniejszyć zużycie energii przez klimatyzator o 5 do 15 procent, zgodnie z amerykańskim Departamentem Energii. Właściciel powinien myć lub wymieniać filtr powietrza raz w miesiącu w sezonie chłodniczym, aby utrzymać kurz z cewek parownika. Częstsze czyszczenie jest konieczne, jeśli urządzenie nadmiernie się zużywa, obszar jest zakurzony lub dom zawiera zwierzęta domowe.
