Głównym konfliktem w "Numerach gwiazd" jest okupacja Danii przez Nazistów w celu pojmania i wysyłania Żydów do obozów koncentracyjnych. W szczególności powstaje konflikt dla głównych bohaterów, gdy rodzina Yohansen ryzykuje życie zaopiekuje się młodą żydowską dziewczyną, Ellen Rosen, aby chronić ją przed nazistami.
W powieści są dwa punkty kulminacyjne, które podkreślają główny konflikt w "Liczbie gwiazd". Pierwsze zdarzenie ma miejsce, gdy żołnierze przeszukują dom Yohansena w poszukiwaniu Ellen i jej rodziny. Po tym jak hitlerowscy żołnierze stają się podejrzliwi wobec Ellen, Pan Yohansen udaje, że jest jego córką, ratując jej życie.
W drugiej kulminacyjnej scenie Annemarie - córka Yohansena - zostaje zatrzymana przez żołnierzy nazistowskich na drodze do dostarczenia paczki mężczyźnie, który pomaga Żydom uciec do Szwecji. Po powstrzymaniu żołnierzy od odkrycia zawartości paczki, Annemarie wąsko unika zatrzymania.
Poza tymi wydarzeniami, na skutek nazistowskiej okupacji i dalekosiężnych skutków II wojny światowej pojawiają się konflikty wtórne. Na przykład kilka postaci traci pracę, domy, a nawet ich rodziny, próbując uniknąć przechwycenia i wysłania do obozów internowania lub pomagając Żydom uciec z Danii. Na poziomie osobistym Ellen zmaga się z konfliktem polegającym na byciu odważnym w obliczu zagrożenia, że nigdy więcej nie zobaczy swojej rodziny.