Patagonia znajduje się na południowym krańcu Ameryki Południowej w obszarze złożonym z terenów podzielonych przez Chile i Argentynę. Jest to bardzo zróżnicowany geograficznie region, w tym dwie linie brzegowe oceanów, południowa część Andy, pustynie, stepy i łąki.
Na północnym krańcu Patagonii znajdują się rzeki Kolorado i Barrancas, które biegną od Andów wzdłuż wybrzeża Pacyfiku do Oceanu Atlantyckiego na wschodzie. Patagonia rozciąga się na południe do Cieśniny Magellana, która wyznacza południowy kraniec południowoamerykańskiego kontynentu. Całkowita powierzchnia Patagonii to nieco ponad 1 milion kilometrów kwadratowych.
