Pasożyty przemieszczają się, poruszając nogami i ciałem. Każda noga wykonuje cykl ruchu do przodu, chwytając się podłoża, pociągając ciało do przodu, a następnie podnosząc się z ziemi i poruszając się do przodu. . W tym samym czasie ciało stonoga porusza się falisto, co pomaga zwiększyć długość kroku stawonogów i pomaga zwiększyć jego prędkość.
Wcześniej naukowcy uważali, że ruchy stonoga na boki są niezamierzoną konsekwencją ruchu nogi i że ciało usiłuje zapobiec falowaniu bocznemu. Jednak badanie z 1995 r. Opublikowane w Journal of Experimental Biology wykazało, że ten pogląd był błędny. Zamiast starać się zapobiec ruchom ciała na boki, wykorzystując mięśnie osiowe ciała, stonogi wysyłają impulsy nerwowe do tych mięśni, które sygnalizują im skurcz, co ostatecznie powoduje ruchy falowe. Widziane z góry, nogi stonogi wydają się poruszać w sposób falisty. Dzieje się tak, ponieważ nogi zwierzęcia nie są zsynchronizowane; zamiast tego działają sekwencyjnie w tak zwanym rytmie metachronowym.
Jednym ze sposobów odróżnienia krocionogów i stonóg jest obserwowanie ich sposobu poruszania się. Podczas gdy stonogi poruszają się, gdy bocznie falują swoje ciała, stonogi pchają swoje ciała naprzód w linii prostej.