Sahara obejmuje duże obszary afrykańskich krajów: Algierii, Czadu, Egiptu, Libii, Mali, Mauretanii, Maroka, Nigru, Sahary Zachodniej, Sudanu i Tunezji. Pustynia ma powierzchnię ponad 3,6 miliona mil kwadratowych, pokrywając około jednej czwartej kontynentu afrykańskiego.
Sahara dzieli się na mniejsze regiony geograficzne, takie jak Pustynia Libijska, pustynia Ténéré, Sahara Zachodnia, Góry Ahaggar, Góry Tybestańskie i Góry Aïr. Najwyższe wzniesienie na pustyni znajduje się w północnej części Gór Tibadyjskich Chad. Szczyt nazywa się Emi Koussi i wznosi się na wysokość 11,204 stóp nad poziomem morza.
Sahara jest ograniczona na wschodzie przez Morze Czerwone, a na zachodzie przez Morze Śródziemne i Ocean Atlantycki. Graniczy od południa z trawiastym obszarem znanym jako Sahel, który jest częścią Sudanu i doliny rzeki Niger. Część Sahary znana jako nubijska pustynia znajduje się w północno-wschodniej części Sudanu, ograniczona przez Morze Czerwone i Nil. Inny region pustyni zwany Tanezrouft znajduje się wzdłuż granicy Mali, Nigru i Algierii, na zachód od gór Hoggar. Pustynia Wschodnia znajduje się w częściach Egiptu, Sudanu i Etiopii.
