Na Filipinach i wokół nich istnieje wiele różnych rodzajów naturalnych form wody, w tym kanały, bagna, cieśniny, zatoki, morza, zatoki, wodospady, rzeki i jeziora. Jako archipelag, kraj linia brzegowa zmierzyłaby w przybliżeniu 10 847 mil, jeśli jest położona od końca do końca.
Filipiny graniczą z Kanałem Babuyan na północy, Morzem Południowochińskim na zachodzie i Morzem Celebes na południu. Wschodnie wybrzeże znajduje się nad Pacyfikiem.
Kilka śródlądowych rzek i jezior na wyspach również zostało utworzonych przez różne działania geologiczne.
- Rzeki: najdłuższa i największa rzeka na Filipinach to rzeka Cagayan w północnym Luzonie. Pod względem wielkości są odpowiednio Rio Grande de Mindanao i Agusan River, obie znalezione w Mindanao. Inne znaczące rzeki to między innymi Bicol, Angat Pampanga, Pasig i Agno w Luzon. Najbardziej znaną rzeką wśród turystów jest podziemna rzeka Palawan.
- Jeziora: najbardziej popularna jest Laguna de Bay w kształcie serca; Jest to również największe jezioro na Filipinach i drugie co do wielkości śródlądowe jezioro słodkowodne w południowo-wschodniej Azji. Inne popularne jeziora to Jezioro Taal, Buhi, Bulusan, Naujan, Mainit i Lanao.
- Wodospady: Wodospady na Filipinach odgrywają bardzo ważną rolę w gospodarce kraju, wytwarzając energię; służą również jako atrakcje turystyczne. Najwyższym wodospadem są dwupoziomowe wodospady Limunsudan znalezione w Barangay Bonbonon. Dokładnie za nim podążają wodospady Maria Cristina. Najbardziej znanym wodospadem na Filipinach jest Pagsanjan Falls położony w Laguna.