Japonia jest krajem wyspiarskim w Azji Wschodniej. Jest to archipelag składający się w sumie z 6 852 wysp. Graniczy z północnym Pacyfikiem, Morzem Filipińskim, Morzem Wschodnio-Chińskim i Morzem Japońskim. Cztery wyspy domowe, Hokkaid ?, Honsh ?, Shikoku i Ky? Sh ?, stanowią około 97 procent masy ziemi tego kraju. Stolica Tokio znajduje się na Honsh?
Góry i lasy pokrywają około 72% Japonii. Najwyższym wzniesieniem w kraju jest góra Fuji, położona na Honsh ?, której szczyt znajduje się na wysokości 12 388 stóp nad poziomem morza. Inne główne góry w kraju to Mount Tate i Mount Haku. Góry Hida, Kiso i Akaishi należą do japońskich Alp, a najwyższa góra w tym zakresie ma górę Kita. Japonia ma także 108 aktywnych wulkanów.
Rzeka Shinano jest najdłuższą rzeką w kraju. Największe jezioro to jezioro Biwa. Najniższe wzniesienie znajduje się w Hachir? Gata, które było drugim co do wielkości jeziorem w kraju, aż do rozpoczęcia rekultywacji terenu w latach 50. XX wieku. Elewacja jeziora znajduje się cztery metry poniżej poziomu morza.
Linia brzegowa w Japonii ma 18486 mil. Większość terenów nadających się do zamieszkania i uprawy leży wzdłuż wybrzeża.
