Płyty główne ATX i BTX są zbudowane nieco inaczej, ze szczelinami umieszczonymi w różnych obszarach, a odległość pomiędzy płytą główną a podwoziem PC wzrosła w BTX. Pod względem układu płyta główna BTX odzwierciedla płytę główną ATX. BTX zapewnia miejsce do instalacji po lewej stronie z pustymi miejscami dla kabli po prawej stronie, a ATX jest układany odwrotnie.
W 2004 roku Intel ogłosił rozwój płyty głównej BTX, mającej zastąpić standard ATX tamtych czasów. BTX obiecał lepszą wentylację wewnętrzną, aby przeciwdziałać wyższym częstotliwościom zegara i większej liczbie komponentów, które generowały więcej ciepła. Wprowadzenie płyty głównej BTX było próbą standaryzacji formatów małych płyt głównych.
Ze względu na układ i różnice konstrukcyjne między płytami główną BTX i ATX, nie można ich zainstalować w wymiennych obudowach. Ponadto płyta główna BTX wykorzystuje gniazda PCI Express z 24-pinową wtyczką, podczas gdy ATX wykorzystuje wtyczkę 20-pinową.
ATX wprowadzono na rynek w 1995 roku, ale uzyskanie standardu zajęło dwa lata. BTX nie osiągnął podobnego sukcesu w handlu detalicznym, częściowo z powodu braku zainteresowania użytkownika ulepszonym systemem chłodzenia. Jednak zarówno Dell, jak i Gateway wydały produkty BTX.
