Ludzie Seneki mają kilka tradycyjnych wierzeń i praktyk religijnych. Istnieje wiara w "posiadacza ziemi" i inne naturalne elementy i siły. Historycznie ludzie organizowali festiwale na cześć truskawek i soku z klonów. Oni również zorganizowali zimową uroczystość, aby dziękować i praktykować przebaczenie. Ludzie wierzyli, że choroba jest wynikiem wpływów duchowych, a szamani używali aż 200 ziół do leczenia i leczenia chorych ludzi.
W dzisiejszych czasach wielu Senuków podąża za religią longhouse, katolicyzmem i innymi wyznaniami chrześcijańskimi. The Longhouse Religion zaczęła się jako ruch religijny zwany "The Code of Handsome Lake". Handsome Lake to imię proroka Seneki, który zapoczątkował religię w 1799 roku. Religia łączy w sobie niektóre tradycyjne poglądy Iroquois z elementami quakeryzmu i chrześcijaństwa.
Kaznodzieje w religii dwa razy w roku recytują objawienie "Przystojnego Jeziora". Pełna recytacja trwa trzy poranki. Dzieje się to przed wschodem słońca. Kaznodzieja stoi przy kominku i śpiewa piosenkę o dobrej pogodzie. Podczas recytacji zbory siedzą na ławkach, a kobiety zakrywają głowy chustami.
Atmosfera przypomina spotkanie chrześcijańskiego odrodzenia. Emocjonalna atmosfera staje się zaraźliwa i sprawia, że ludzie publicznie deklarują wierność religii.
