Zmodyfikowane łodygi to pędy roślin, które wykonują specjalne funkcje potrzebne do przetrwania roślin w określonych środowiskach. Te łodygi mogą mieć nieprawidłowe kształty i rosnąć nad ziemią lub pod nią.
Niektóre zmodyfikowane pędy rosną ponad ziemią. Kłódki biegają nad ziemią lub tuż pod powierzchnią w poziomie. Są ważne dla produkcji wegetatywnej. Stolony tworzą się w miarę wzrostu, tworząc nowe rośliny. Ludzie zwykle odnoszą się do rozłogów, które rosną na ziemi jako biegacze.
Tendrils to smukłe łodygi, które rosną i owijają się wokół przedmiotów, aby zapewnić wsparcie dla rośliny. Ciernie są zmodyfikowanymi gałęziami, które chronią roślinę. Pąki przypominające cebulki w kształcie żołędzi lub cebulki przechowują żywność, a ostatecznie odpadają z rośliny i produkują nowe rośliny. Fotosynteza opiera się na kladodach lub zielonych gałęziach, które nie rosną bardzo długo.
Zmodyfikowane łodygi, które rosną pod ziemią, obejmują bulwy, cebule, kłącza i pędy podziemne. Bulwy znalezione na ziemniakach mogą przechowywać skrobię. Pojawiające się na końcu rozłogów bulwy są powszechnie określane jako oczy na ziemniakach.
Rośliny używają żarówek, które przypominają okrągłe, mięsiste modyfikacje pędów, do przechowywania. Kłącza rosną poziomo pod ziemią, ale mogą wytwarzać pionowe pędy. Corms są zmodyfikowanymi łodygami, które przypominają kłącza, ale są grubsze i bardziej zaokrąglone. Corms służą do magazynowania żywności dla roślin i zapewniają przetrwanie w trudnych warunkach zimowych.