Od 2015 r. dziewczyną Billa Mahera jest Anjulie Persaud. Od 2014 r. są małżeństwem. Persaud jest kanadyjską piosenkarką i autorką tekstów, a Nicki Minaj wykonała swoją pracę. Persaud napisał przebój "Do not Call Me Baby" dla Kreesha Turner.
Maher, prowadzący program telewizyjny "Real Time with Bill Maher", nigdy się nie ożenił. W latach 2003-2004 miał na imię Coco Johnsen, były model Cyberpianczyka Playboya. Johnsen pozwał go za 9 milionów dolarów za ból i cierpienie i twierdził, że obiecał ją poślubić. Sędzia odrzucił pozew. Inne dawne dziewczyny to neuronaukowiec Cara Santa Maria i model hip-hopowy Karrine Steffans.