Od roku 2015 Bill O'Reilly nie jest żonaty, ale był żonaty z Maureen McPhilmy w latach 1996-2011. Para poznała się w 1992 r., wyszła za mąż 2 listopada 1996 r., oddzielona w 2010 r. i oficjalnie rozwiodła się w 2011 roku. Para ma dwoje dzieci, Madeline i Spencer.
W 2015 r. McPhilmy oskarżyła O'Reilly o fizyczne nadużywanie jej. Około rok przed ich rozdzieleniem córka pary podobno zobaczyła, jak O'Reilly chwyta McPhilmy za gardło i ciągnie ją po schodach. O'Reilly zaprzeczył zarzutom i wielokrotnie występował przeciwko przemocy domowej podczas swojego występu "The O'Reilly Factor."