Znaczenie "genotypu" jest wewnętrznym składem genetycznym organizmu lub komórki. Masy genetyczne organizmu określają jego cechy fizyczne i przewidują fizyczne cechy jego potomstwa.
Termin "genotyp" jest zwykle używany w odniesieniu do określonej cechy. Zasadniczo genotyp odnosi się do wszystkich genów, które niesie organizm, niezależnie od tego, czy te geny ulegają ekspresji. Organizmy, które rozmnażają się seksualnie, zazwyczaj mają dwie kopie określonego genu. W niektórych przypadkach gen może być recesywny dla innego odpowiednika genu, co oznacza, że jeśli obecny jest odpowiednik genu, ulega ekspresji zamiast genu recesywnego. Dlatego też organizm może przenosić gen recesywny bez jego ekspresji i chociaż gen nie jest fizycznie widoczny, można go przenieść na przyszłe potomstwo. Mówi się, że organizm ma cechę recesywną.
