Uzupełnienie Pokédexu gwarantuje różne nagrody z pokolenia na pokolenie, w zależności od ukończenia regionalnych i krajowych Pokédexów. Różni się to od braku nagrody do uzyskania przydatnych przedmiotów. We wszystkich grach gratulacje i dyplom od dyrektora gry za przechwycenie wszystkich dostępnych Pokémonów.
W pierwszych dwóch pokoleniach nie otrzymujesz dodatkowych nagród. Pierwsza gra, w której dostaniesz dodatkową nagrodę, to Pokémon Emerald, w której dostajesz starter Johto od profesora Bircha za ukończenie Hoenn Regional Dex. W Diamencie, Perle i Platinum, samo zobaczenie wszystkich Pokémonów w Pokerze Sinnoh daje ci dostęp do National Dex, obszaru walki i obszaru przetrwania. Później, w Black 2, White 2, X i Y, otrzymasz Oval Charm za ukończenie regionalnego Dex, co przyspieszy hodowlę, oraz Shiny Charm za ukończenie National Pokédex, co zwiększa szanse na spotkanie z Pokémonem innego kolor. Czarny 2 i Biały 2 również nagradzają biletem do Rezerwatu przyrody, aby zobaczyć wszystkie Pokemony Unova.