Ibuprofen jest względnie niepolarny. Dzieje się tak dlatego, że ma niepolarne grupy alkilowe i pierścień benzenowy, który zmniejsza ogólną polarność cząsteczki wnoszonej przez jej grupę karboksylową. Dlatego ibuprofen jest słabo rozpuszczalny w wodzie, rozpuszczając tylko 21 miligramów na litr wody w temperaturze 25 stopni Celsjusza.
Niepolarna właściwość Ibuprofenu sprawia, że jest on bardzo dobrze rozpuszczalny w alkoholu i większości rozpuszczalników organicznych. Aby uczynić ibuprofen bardziej rozpuszczalnym i szybciej działającym, można go mieszać z solą lizyny. Wprowadzenie ibuprofenu w żel i zmieszanie go z rozpuszczalnikiem, takim jak 2-propanol, który ma większą polarność, ułatwia wchłanianie przez polarną warstwę wewnętrzną skóry.
