Kilka gatunków węży, w tym boa Cropan, pyton Ramsaya i boa Round Island, są zagrożone od 2014 r. Węże morskie o krótkich węchach i liściach, które żyją w rafach koralowych otaczających Australię, są również krytycznie zagrożone.
Węże mają niewiele naturalnych drapieżników, które znacznie zmniejszają ich liczebność, więc zagrożenie gatunków jest często związane z przyczynami środowiskowymi. Węże o stosunkowo niewielkich powierzchniach, takie jak boa brazylijskiego Cropana i wąż podwodny w Ameryce Północnej San Francisco, są podatne na niebezpieczeństwo, ponieważ ludzkie osady wkraczają w ich naturalne siedliska. Boa z Round Island stała się krytycznie zagrożona, a jej względna boa z rundy Round Island wyginęła, kiedy udomowione zwierzęta przywiezione na wyspę drastycznie zmniejszyły liczbę jaszczurek, które były głównym źródłem pożywienia węży.