Oddychanie komórkowe mierzy się przede wszystkim za pomocą dwóch różnych metod: jednej, która mierzy zmiany temperatury w czasie i drugiej, która wykorzystuje wymianę i zużycie różnych gazów za pomocą respirometru. Ciepło może być używane do pomiaru oddychania komórkowego, ponieważ jest to proces egzogeniczny. Ponieważ oddychanie jest tak ściśle związane z różnymi gazami, respirometry i gazy pomiarowe mogą być również skutecznie wykorzystywane.
Oddychanie komórkowe to proces składający się z wielu różnych reakcji metabolicznych zachodzących wewnątrz komórek organizmów. Procesy te są w stanie przekształcać różne rodzaje składników odżywczych w energię i wytwarzać różne produkty odpadowe.
Pomiar szybkości, z jaką komórka przechodzi przez oddychanie, można wykonać na wiele sposobów. Jednym prostym sposobem jest śledzenie ciepła komórki. Jest to możliwe, ponieważ proces przekształcania składników odżywczych w energię wytwarza ciepło. Fluktuacje we wzorcach ciepła w komórce mogą być analizowane, aby dać naukowcom pojęcie szybkości, z jaką oddychają. Dodatkowo można stosować pomiar niektórych gazów, zwłaszcza tlenu i dwutlenku węgla. Wynika to z faktu, że tlen jest zużywany podczas tego procesu, a dwutlenek węgla jest produkowany jako odpad. Różne poziomy tlenu i dwutlenku węgla mogą wskazywać, czy komórka niedawno przeszła proces oddychania.