99-minutowa, 4,7-calowa (12 cm) płyta CD-R może pomieścić 999,3 megabajtów danych. 99-minutowe puste płyty CD-R nie są jednak tak popularne jako standardowy 74-minutowy dysk o pojemności 670 MB z powodu problemów z nagrywaniem i odczytaniem związanych z poprzednim.
Chociaż różne płyty CD-R są sprzedawane z określoną maksymalną pojemnością do przechowywania danych, zwykle można zapisywać więcej danych lub "nadpisywać" dane na dysku poza podaną pojemnością. Wynika to z faktu, że pojemność dysków CD-R jest mierzona za pomocą standardowych danych audio Red Book, które zapewniają przydział na 90 sekund cyfrowej ciszy.
Cichy lub pusty obszar nazywany jest "wyprowadzeniem" i jest on zawarty w większości płyt CD-R wraz z innymi standardowymi obszarami, takimi jak obszar wejściowy i program. Ten sam pusty obszar może zostać wykorzystany do zapisania dodatkowych danych na dysku podczas jednej sesji nagrywania CD.
Z drugiej strony płyta wielosesyjna traci dostępną przestrzeń do przechowywania danych podczas każdej sesji nagrywania danych. Podczas pierwszej sesji nagrywania utracono około 23 megabajty danych. Kolejne sesje nagrywania danych spowodują utratę 14 megabajtów przestrzeni dyskowej w każdej sesji.
Niektóre napędy CD-R używają specjalnych technik w celu zapisania większej ilości danych na płycie CD-R. Jednak dane zapisane na płycie CD-R mogą nie być zgodne i czytelne w innych standardowych odtwarzaczach CD-R.
