Chociaż w Pokémonie nie może być żadnej "najlepszej" drużyny, istnieją listy poziomów, które określają najlepszego pokemona w każdym pokoleniu na podstawie ich statystyk, skuteczności w walce i rankingu w stosunku do innych Pokemonów. Ze względu na nowe ruchy, nowe pokemony i nowe typy w każdym pokoleniu, poziomy te zmieniają się w każdej grze. W przypadku Pokémon Emerald najlepszymi Pokémonami są poziom trzeciej generacji.
W Pokémonie jest dziewięć oficjalnych poziomów: nie w pełni rozwinięta, mała filiżanka, nigdy nie używana, granica 3, rzadko używana, granica 2, niedostateczne wykorzystanie, granica, nadużywanie i uber. Warstwa uber zawiera najpotężniejszego Pokémona. Warstwa trzecia generacji składa się wyłącznie z legendarnych Pokemonów, z wyjątkiem Wobbuffeta i Wynauta. Należą do nich Mewtwo, Mew, Lugia, Ho-oh, Latias, Latios, Kyogre, Groudon, Rayquaza i wszystkie formy Deoxys. Warto jednak zauważyć, że obejmuje to tylko sześć z 17 dostępnych typów w Pokémon trzeciej generacji. Dlatego zespół, w którym znajdują się tylko te Pokémony, może nie pasować do innych drużyn wyłącznie ze względu na wady typu. Być może warto użyć Pokémonów z bardziej zróżnicowanego, nadużywanego poziomu. Należą do nich Pokémon, takich jak Gengar, Rhydon, Umbreon i Raiku. Ważne jest również rozważenie szkolenia i umiejętności EV. Przy odpowiednim treningu nawet Pokémon z jednego z niższych poziomów może wytrzymać uber lub nadużyć.
