Prawie wszystkie wirusy są ważne z ekonomicznego punktu widzenia, a dwa typy są zdecydowanie najbardziej znaczące. Po pierwsze, wirusy owadzie mogą być stosowane jako formy zwalczania szkodników w celu ochrony upraw gotówkowych. Po drugie, rozprzestrzeniające się ludzkie wirusy mogą znacząco wpłynąć na wyniki gospodarcze dotkniętego obszaru.
Typowe formy wirusów owadzich znane jako bakulowirusy stały się powszechne we współczesnych arsenałach zwalczania szkodników. Te szczepy wirusów mają zdolność zakażania ponad 600 różnych gatunków owadów. Dzięki wykorzystaniu tego wirusa jako środka odstraszającego owady, rolnicy mogą zaoszczędzić setki tysięcy dolarów rocznie bez narażania upraw na szkodliwe chemikalia obecne w pestycydach.
Z drugiej strony, ludzkie wirusy, szczególnie te, które prowadzą do śmierci, mogą mieć poważne negatywne reperkusje ekonomiczne. Na przykład wirus Ebola w Afryce spowodował straty ekonomiczne w wysokości ponad 1,6 miliarda dolarów, paraliżując gospodarki narodowe Gwinei, Sierre Leone i Liberii. W tym samym duchu Światowa Organizacja Zdrowia projektuje, że wirus HIV /AIDS może każdego roku odejmować 1% od produktu krajowego brutto w sporej liczbie krajów Afryki Subsaharyjskiej. W Południowej Afryce Światowa Organizacja Zdrowia podejrzewa jednak, że straty spowodowane przez szerzący się wirus HIV /AIDS mogą co roku obniżyć o 17% PKB każdego kraju.