Pochodzenie nazwy "Wisconsin" było mocno dyskutowane, ale wielu historyków sądzi, że wywodzi się z indyjskiego amerykańskiego słowa "Meskonsing", co oznacza "rzeka biegnąca przez czerwone miejsce". Meskonsing to wczesna nazwa rzeki Wisconsin, która zawiera brzegi czerwonego piaskowca.
Meskonsing to francuska pisownia indyjskiej nazwy Miami "Meskousing" lub "Mescousin". W 1674 odkrywca Rene Robert Cavelier, Sieur de La Salle przypadkowo rozprzestrzenił francuską wymowę "Ouisconsin" po błędnym odczytaniu listów w dzienniku misyjnym. W latach dwudziestych XIX wieku amerykańscy politycy stopniowo przyjęli angielską pisownię fonetyczną "Wisconsin" i spopularyzowali jej użycie, włączając ją do publikacji rządowych. Do lipca 1836 ta nowoczesna wersja została uznana za oficjalną pisownię.