Do czynników abiotycznych w ekosystemie jeziora należą nieżywotne składniki, takie jak światło, temperatura, pH wody i zawartość tlenu. Czynniki biotyczne obejmują żywe składniki jeziora, takie jak bakterie, fitoplanktony, rośliny wodne, zooplankton, skorupiaki, mięczaki, owady, ryby i inne kręgowce.
Czynniki abiotyczne to warunki lub przedmioty, które wpływają na ekosystem i żywe organizmy jeziora. Jednym z najważniejszych czynników abiotycznych jest słońce, które zapewnia światło i ciepło. Światło pomaga w podtrzymaniu fotosyntezy w fitoplanktonach i roślinach wodnych. Temperatura wody jest kolejnym ważnym czynnikiem abiotycznym, ponieważ kilka organizmów w ekosystemach jezior nie jest w stanie regulować wewnętrznej temperatury ciała; dlatego zależą one od temperatury otoczenia. Temperatura wody jest wyższa bliżej powierzchni jeziora, podczas gdy dolna strefa jeziora pozostaje chłodna. Zimą warstwa lodu może tworzyć się nad jeziorem i zmieniać temperaturę i dostępność światła. Wiatr wpływa na wodę powierzchniową jeziora i znajdujące się na nim żywe organizmy. Chemizm jeziora, taki jak pH i stężenie rozpuszczonego tlenu, również determinuje rodzaj obecnego ekosystemu.
Czynniki biotyczne obejmują żywe organizmy, które wpływają na ekosystem jeziora. Bakterie pomagają w rozkładaniu odpadów i są obecne w jelitach kilku organizmów. Jeziora mają również takich producentów, jak fitoplankton (na przykład glony) i rośliny wodne. Poprzez fotosyntezę, wykorzystując światło słoneczne, rośliny wytwarzają materiały spożywcze, które są konsumowane przez inne organizmy. Bezkręgowce, takie jak zooplankton, mięczaki, skorupiaki i owady, zużywają składniki odżywcze od pierwotnych producentów i przekazują je na wyższy poziom konsumentom, a mianowicie kręgowcom, takim jak ryby.