Najrzadsze karty Pokémon to karty Pikachu Illustratora. Tylko cztery istnieją na świecie, a jedna ostatnio trafiła do sprzedaży w serwisie eBay za 100 000 $.
Inne rzadkie karty Pokémon to karty trenerów Numbers 1, 2 i 3; karty Raichu przed wydaniem; oraz karty Tropical Mega Battle 2001. Rzadkość kart Trenera Liczb 1, 2 i 3 wynika z tego, że jeden z nich zostanie wydany rocznie podczas Światowego Finału TCG. Wydawcy ograniczają pre-release karty Raichu do 10 do 15 kart na całym świecie, z szacowaną wartością ponad 10 000 $ na kartę. Wydawcy ograniczają liczbę kart Tropical Mega Battle 2001 do 12, więc sprzedają za ponad 10 000 USD.
