Według WebMD, jogurt jest uważany za bezpieczny i stwarza niewielkie ryzyko wystąpienia działań niepożądanych u zdrowych osób. Z tego powodu jogurt może być regularnie spożywany przez dzieci, dorosłych i kobiety w ciąży w ramach diety. W niektórych przypadkach jogurt został skażony bakteriami, powodując choroby. Z tego powodu ważne jest, aby jogurt był odpowiednio przygotowany i przechowywany, aby zapobiec zanieczyszczeniu.
W przypadku osób z osłabionym układem odpornościowym, takich jak osoby zakażone HIV lub poddane przeszczepom narządów, jedzenie jogurtu stanowi niewielkie ryzyko. W takich przypadkach istnieje ryzyko, że Lactobacillus, jedna z żywych bakterii w jogurcie, może mieć zdolność rozmnażania się do poziomu wewnątrz organizmu, który może powodować choroby. Chociaż jest to rzadkie, osoby z upośledzonym układem odpornościowym powinny unikać spożywania dużych ilości jogurtu zawierającego żywe kultury bez uprzedniego skontaktowania się z lekarzem.
Jogurt wytwarzany w drodze fermentacji mleka jest stosowany jako środek leczniczy w celu przywrócenia prawidłowych bakterii znajdujących się w jelitach po zastosowaniu antybiotyków. Regularne spożywanie jogurtu okazało się skuteczne w leczeniu infekcji bakteryjnych i drożdżowych pochwy, a także w zapobieganiu infekcjom dróg moczowych. Zużycie jogurtu jest również skuteczne w leczeniu wysokiego poziomu cholesterolu i leczenia infekcji Helicobacter pylori.
