Zbiorniki wodne na Bliskim Wschodzie obejmują rzekę Amu Daria, rzekę Eufrat, rzekę Indus, rzekę Tygrys, Zatokę Perską i Nil. Największe jezioro na Bliskim Wschodzie to Jezioro Urmia w północno-zachodnim Iranie, które ma powierzchnię 2000 mil kwadratowych i maksymalną głębokość 52 stóp.
Zbiorniki wodne graniczące z krajami Bliskiego Wschodu obejmują Ocean Indyjski, Morze Śródziemne, Morze Czerwone, Morze Czarne, Zatokę Adeńską, Morze Arabskie, Zatokę Perską i Morze Kaspijskie.
Kanał Sueski, sztuczny zbiornik wodny w Egipcie, który łączy Morze Śródziemne i Morze Czerwone, w 1869 roku otworzył przejście do statków handlowych. Ma długość 100,82 mil, z dwoma kanałami dostępowymi o długości 14 mil i 5,6 mil. .
Rzeka Nilu o długości 4 258 mili, która płynie przez Egipt, jest najdłuższą rzeką na świecie. Jego ujście znajduje się na wybrzeżu Egiptu z Morzem Śródziemnym.
Rzeka Eufrat płynie przez Turcję, Syrię i Irak, kończąc swoją trasę w Zatoce Perskiej. Starożytne miasto Babilon znajduje się na brzegach rzeki.
Rzeka Indus i Tygrys łączą się, by stać się Shatt al Arab River, która również wypływa do Zatoki Perskiej. Rzeka Tigris ma 1180 mil długości.