Z powodu różnorodności terenów i ekosystemów, Peru jest domem dla 500 gatunków ssaków, w tym pum, jaguarów, niedźwiedzi okularowych, żółtych wełnianych małp, lam, alpak i wikontów. ssakom Peru ma 1800 gatunków ptaków i 300 gatunków gadów.
Spośród 500 gatunków ssaków w Peru 70 jest endemicznych, a prawie 100 jest zagrożonych lub zagrożonych. Wśród rzadkich gatunków endemicznych są jaguar, niedźwiedź okularowy i żółto-wełnista małpa.
Las deszczowy w Peru jest częścią amazońskiego lasu deszczowego, który jest domem dla wielu rzadkich gatunków ptaków, gadów i ssaków, których nie ma nigdzie indziej. Na wybrzeżu Pacyfiku w Peru wiele gatunków przystosowało się do życia w suchym klimacie pustynnym. Wody przybrzeżne Pacyfiku wspierają ogromne życie ryb i ptaków morskich, w tym pingwin Humboldta. Peru jest również znane ze swoich gór. Góry te wspierają wzrost wielu traw i roślin, które służą jako pokarm dla lam, alpak i wikarów. Ssaki żyjące w Peru przystosowały się do życia na dużych wysokościach.
W 2007 r. naukowcy odkryli nowy gatunek gryzonia w lesie deszczowym w Peru. Jest blisko spokrewniony z kolczastym szczurem. Od 2014 r. Naukowcy nadal odkrywają nowe gatunki w różnych ekosystemach Peru.
