Doktryna Kościoła Chrystusowego pochodzi z pierwszego wieku nauczania Nowego Testamentu Jezusa Chrystusa i zawiera XIX-wieczne nauki z Księgi Mormona. Kongregacje współpracowały ze sobą, by zdefiniować ich wierzenia i ustanowić doktrynę Kościoła Chrystusowego pod koniec lat 50. XIX wieku.
Odmienne interpretacje nauk Biblii i Księgi Mormona doprowadziły do schizmy, która stworzyła dwa odrębne kościoły. Cztery zbory w Illinois na wsi utworzyły konferencję w 1853 roku, przysięgając pozostać wierne doktrynie Kościoła Chrystusowego, podczas gdy druga konferencja utworzyła Kościół Jezusa Chrystusa Świętych w Dniach Ostatnich. Współczesna doktryna Kościoła Chrystusowego wciąż cytuje nauki z Biblii i Księgi Mormona w artykułach wiary i praktyce Kościoła.
