Peanut the Royal Blue Elephant, Coral Casino the Bear, Pułapka na myszy i Slither the Snake to jedne z najniezwyklejszych i najdroższych kolekcjonerskich TY Beanie Babies. Inne rzadkie Beanie Babies to Peking the Panda, Senna-Kun the Dog, niedźwiedź Softbank Hawks i niedźwiedź Hong Kong. Spośród tych rzadkich TY Beanie Babies, te, które osiągają najwyższą cenę sprzedaży, zawierają wciąż zamontowany oryginalny tag hang.
Dinozaur rex, dinozaur Steg, dinozaur z Bronpem i Caw the Black Crow to rzadkie kolekcjonerskie Beanie Babies. W każdym z trzech pokoleń Beanie Babies, istnieje kilka rzadkich zwierząt, które dowodzą wysokimi cenami, gdy są w idealnym stanie. Bumble the Bee, Dusty the Bear, Lucky the Ladybug, Manny the Manatee i Princess the Bear to inne Beanie Babies, które są mniej rzadkie niż niektóre inne, ale wciąż są wyceniane znacznie wyżej niż ich pierwotna cena zakupu.
Wiele rzadkich kolekcjonerskich Beanie Babies upamiętnia konkretne wydarzenie i były one dostępne tylko w momencie zakupu, dzięki czemu ich wydanie jest jeszcze bardziej ograniczone. Jeszcze rzadsze Beanie Babies są zwierzętami krótkoterminowymi, które zostały przerwane lub zmienione, ograniczając ilość wyprodukowanych i zwiększając ich koszt.