Małpy kapucyńskie to zwierzęta wszystkożerne, które jedzą owoce, orzechy, nasiona, pąki, owady, pająki, jaja ptaków i małe kręgowce. Małpy kapucynów żyjące w pobliżu wody również jedzą kraby i skorupiaki, łamiąc ich skorupy otwórz z kamieniami.
Małpy kapucynów muszą mieć zróżnicowaną i zdrową dietę zawierającą mnóstwo małych owoców, takich jak winogrona i rodzynki oraz kawałki jabłek, gruszek, mango, arbuza, kantalupa i kiwi. Dodatkowo jedzą warzywa, takie jak kapusta, jarmuż, szpinak, gotowana marchewka i słodkie ziemniaki. Liście są również ważne i obejmują Eugenię, hibiskus, morę i klon.
Małpy kapucyńskie w niewoli powinny otrzymać ludzką formułę dla niemowląt. Mleko sojowe jest niezbędne, ponieważ soja może prowadzić do agresji, gdy małpa staje się dorosła. Alternatywą jest mleko kozie. Ponieważ małpa jest odstawiana od butelki, opiekunowie powinni uzupełniać dietę małymi herbatnikami przez resztę swojego życia.
Przysmaki, które małpy kapucynów mogą jeść, obejmują warzywa z mikrofali, robaki z jedzeniem, świerszcze, namoczone rodzynki, gotowane jajka, kluski i mieszankę sałaty, które zostały dobrze posiekane. Należy unikać pokarmów wzbogaconych w żelazo, w tym wzbogaconych zbóż.
Ilość jedzenia, którą małpa kapucyna powinna jeść, zależy od jej wagi i metabolizmu. Bez względu na ilość pokarmu w każdym posiłku ważne jest oddzielenie pokarmu na dwa karmienia dziennie.