Gekony są pożytecznymi drapieżnikami owadów i mogą być wykorzystywane jako naturalny sposób redukcji szkodliwych lub uciążliwych owadów, takich jak karaluchy, termity, mole, mrówki i komary. Żywią się żywymi rzeczami, które są mniejsze niż oni i są naturalnie łatwe do opanowania. Gekony mogą być również spożyte stawonogów, takich jak pająki, małe skorpiony i stonogi.
Większość gekonów żywią się owadami, chociaż niektóre gekony żyjące w środowisku naturalnym mogą również spożywać mchy i inne małe rośliny. Na wolności jedzą świerszcze i koniki polne. Gekony azjatyckie i śródziemnomorskie nie są agresywne z natury, a nocne jaszczurki zazwyczaj polują na jedzenie w nocy. Mają pazury i lepkie ochraniacze, które pozwalają im wspiąć się i powiesić na ścianach, sufitach, drzewach i innych budowlach, czekając na swoją zdobycz. Gekony domowe latają wokół oświetlonych obszarów, ponieważ zwykle polują na owady przyciągane do światła.
Nie wszystkie gekony są korzystne dla zwalczania szkodników. Tokajski gekon, duży gekon z Azji Południowo-Wschodniej z jasnymi oznaczeniami, może być dość agresywny. Choć karmi się także owadami, tokajski gekon może również konsumować mniejsze zwierzęta i gryźć ludzi. Gekony domowe mogą być również uważane za szkodniki, zwłaszcza jeśli ich odchody plamią ściany, dywaniki, dywany i meble w domach mieszkalnych.
