Pastor John Hagee rozwiódł się z pierwszą żoną, Marthą, w 1975 roku. Oboje byli małżeństwem od 15 lat i mieli dwoje dzieci: syna o imieniu Christopher i córkę o imieniu Tish.
Pastor Kościoła Kościoła węgielnego poślubił swoją drugą żonę, Dianę, około rok później. Ma on trójkę dzieci z żoną Dianą - Matthew, Christiną i Sandy - oraz ośmioro wnucząt od 2014 r. Mateusz został pastorem w kościele swojego ojca.
Poza byciem proboszczem dużego, bezwyznaniowego kościoła, Hagee napisał także wiele książek i często podróżuje wraz z rodziną jako członek grupy śpiewaczy.
